fwconsole validate - Проверка FreePBX на возможные атаки
fwconsole validate --clean - Проверка FreePBX на возможные атаки и чистит за собой

Исправление ошибки

fwconsole chown - исправление прав доступа
fwconsole ma refreshsignatures - исправление измененных файлов
fwconsole reload - перезагрузка
fwcontrol ma upgradeall - обновление

Скачиваем и устанавливаем модуль обновления FreePBX:
fwconsole ma downloadinstall versionupgrade

Проверяем доступность новой версии FreePBX:
fwconsole versionupgrade --check

Запускаем обновление FreePBX, процесс долгий, запаситесь попкорном:
fwconsole versionupgrade --upgrade

Еще информация из других источников:

voxlink.ru - Использование fwconsole во FreePBX 13

wiki.merionet.ru - ОБНОВЛЕНИЕ FREEPBX ДО 13 ВЕРСИИ